1、两所学校办学层次不一样：北师大珠海分校是北京师范大学和珠海市人民政府共同筹办的，属于“独立学院”。在广东省内招生属于本科二批A类。而北京师范大学是中华人民共和国教育部直属、中央直管副部级建制的全国重点大学，是具有双一流资格的重点高校，即为985和211的大学。2、北师大珠海分校位于广东省珠海市内，占地5000亩。而北京师范大学是位于北京市海淀区，占地50000平方米左右。办学规模比北师大珠海分校是要高的。

　　3、尽管北师大珠海分校作为北师大的一个分校，北师大珠海分校和北师大两所学校毕业生所拿到的毕业证是不一样的。珠海分校的毕业证上是会带有珠海分校标注的。而北京师范大学的毕业证则没有。